慣用語（不知是否也常對美青姐這樣講）
「謝謝指教。」
「一切依法辦理。」
「這其中必有誤會。」
2010年
美國CNN主播越洋專訪：美國人為何要冒如此大的風險防衛台灣？
He said: "We will never ask the Americans to fight for Taiwan."（我們絕對不會要求美國為台灣而戰）
胡錦濤卻是這樣想：「我們根據客觀形勢確定用統戰方式為主解決台灣問題，並不是要取消軍事鬥爭的準備。恰恰相反，越是想要和平解決台灣問題，越是要作好軍事鬥爭準備。我們能夠用統戰方式達到戰略目的，主要依賴於我們強大的經濟、政治實力，特別是軍事實力；沒有大的軍隊和充分的軍事鬥爭的準備作後盾，和平統一是不可能成功的。全黨全軍對此必須有清醒的認識。不戰而屈人之兵，是最高戰略。但不戰而能屈人之兵，要以無堅不摧的戰力為基礎。」
國道三號山崩意外
｢到目前為止原因不明，那我心裡面有點毛毛的。｣
關於女兒持有美國籍
「為什麼要放棄？」
聽完一場氣候變遷演講，會後發表其結論：「水管破裂溢出的水能補充地下水。」
出席音樂大師黃友棣追思會，馬英九表示能在生日後隔天來送大師最後一程，讓他深感「榮幸、欣慰」。
2009年與2010年皆曾在接見運動代表隊時，把運動員說成「動物園」。
2009年，這年發生全國哀悼的八八風災
災民：｢我們全家都把票投給你，為什麼我們變得要見你，變得這麼難啊？｣
馬英九：｢我不知道你要見我，這不是見到了嗎？｣
面對曾被土石活埋而窒息小朋友，馬：｢妳真不簡單，可以憋氣二分鐘。｣
對於六龜救災感言：｢我今天早上一打開報紙，說六龜好像都沒有國軍，我嚇一大跳！｣
接受INT採訪，表示災民死傷都是活該：「Just because they stay in where they live and, but you see, they didn't learn, they didn't realize how serious this disaster was.」
旗山國中勘災，災民不耐總統致詞而哭求別再說話，趕快救人時，馬英九用食指對災民比噓，要求災民安靜。
太麻里勘災，災民因父親失蹤崩潰陳情，馬回答：「我四年前失去了父親，我非常可以感受，一個做兒子的心情。」（災民遭維安人員拖離）
台南縣養豬場勘災，看見受災戶牆上掛有蔣經國、謝東閔的照片，興奮驚呼：「喔，哇！這是行政院長是不是？這是謝副總統耶，我還是第一次看到他穿布鞋。」
風災後中外記者會現場，對死傷慘重表示：「他們已經得到教訓，下次配合度應該會比較高。」
至嘉義縣看見來吉村災民舉布條陳情，馬說：「讓我講完再救你們！」並要求災民轉身，否則白布條就白拿了。等自己想講的講完後，說：「好！我們現在可以開始救你們了！」
馬以南在921震災10週年新書發表會透露，馬英九曾寫e-mail向她抱怨「哼！好人沒好報。」
在總統府與國防部官員會面時，把加勒比海講成「芭樂比海」。
誇讚苗栗縣長劉振鴻：「劉縣長非常棒，世界三大男高音，他已經請了兩個來，希望將來也能把第三個也請來。」（第三個帕華洛帝已於2007年辭世）
探視失業後接受立即上工方案的人員，稱讚對方才失業一個月就有新工作：「才一個月，那你很幸運！」
參加調查局調查員結業式，馬英九原本（應該）是要告訴調查員「訊問時不要抽煙」，卻講成「要抽菸不要在刑求的時候抽。」
2008年
總統大選辯論會，面對提問633如果做不到的話，將四年薪水捐一半給聯合勸募：｢你放心，捐款沒有問題。｣
視察台風淹水災區後，在工研院發表意見：「居民的表情都很Cynical！」（翻譯：居民看起來揪GBㄟ）
雲林農民抱怨小偷太多，馬英九回應：「怎麼不學學台北市裝設感應路燈，有人經過就會亮，這樣小偷就不敢來了。」
面對三聚氰胺風波造成國人不敢食用進口乳製品，愉快表達：「我們本地的酪農，好像也發了一筆小財，這倒是我感到很高興的。」
設宴招待官員，認真教導台下：「官員要能『苦民所苦』。」
2007年
參選總統的原因：「我一生廉潔，竟然遭到起訴，這比我失去生命更痛苦，在社會正義難以伸張的此刻，我要化悲憤為力量，參選2008總統大選！」
在屏東縣騎腳踏車：「遠離台北，遠離政治口水，真是無比的爽！」
面對拒絕拆遷的溪州部落阿美族人說：「我把你當人看，我把你當市民看，要好好把你教育，提供機會給你，我覺得應該這樣子做，所以我覺得原住民的心態要從那個地方調整，我來到這個地方，我就要照這個地方的遊戲規則來玩。」
為參選總統，至社子島住宿，忘記他自己當了八年市長，發表感想：「社子島像三等市民，九年來都沒變。」
喝喜酒喝醉，嬌滴滴對媒體否認：「沒有啦～」一戰成名。
2006年
談論他人的不懂反省：「我覺得他們都失去了反省能力。他們要把責任丟到我身上，是不會成功的！」
對自己挺貪腐的解釋：「雖然我選舉時力挺許財利，但是許財利貪汙該不該下台，這要問老天爺，要問內政部，不要來問我。」
台北市議會總質詢
顏聖冠：｢特別費可以拿去當生活費嗎？｣
馬英九：｢特別費我們不會拿來當生活費。｣
顏聖冠：｢特別費應該是公務使用的費用，對不對？｣
馬英九：｢是。｣
顏聖冠：｢如果你把特支費當成生活費使用的話，你怎麼辦？退出政壇啊？｣
馬英九：｢我跟妳講，現在我這裡親口告訴你，我的特別費都是用在公務跟公益。｣
顏聖冠：｢如果被查到你把特別費...... ｣
馬英九：｢那妳去告嘛...有問題妳去檢舉啊.....去告嘛！｣
事後證明，馬英九特別費發票包含有私人之小狗醫療費、黛安芬內衣、美少女戰士等物品。
2001年，還在當台北市市長。
納莉颱風來襲前，被問到是否擔心颱風災情，馬市長信誓旦旦地說：「我們已有萬全準備」。
（結果台北市11座抽水站泡湯，全市3萬多棟房子大淹水，15萬輛汽車淪為泡水車，2721棟大樓地下室淹水，是全國其他地區總合的4倍，就連市府大樓也全面滅頂，全市共有30人罹難。大水順著捷運板南線穿越都市，捷運因此停擺3個多月。馬英九表示，這是因為中央氣象局預報資料不夠準確。）
